Чем FISH отличается от NGS в ПГТ: сравнение методов

Сравнение FISH и NGS в лаборатории ПГТ

Чем FISH отличается от NGS в ПГТ: сравнение методов​

В обсуждениях ПГТ часто встречаются два термина FISH и NGS. Это разные лабораторные технологии анализа генетического материала эмбриона. Они не равнозначны по возможностям и объёму информации. Разберём спокойно, чем они отличаются, что именно проверяют и почему сегодня чаще используют NGS.

Что такое FISH​

FISH это метод флуоресцентной гибридизации. С его помощью можно проверить определённые хромосомы, к которым прикрепляются специальные метки. Лаборатория видит наличие или отсутствие сигнала по выбранным участкам. Метод позволял анализировать ограниченное число хромосом. Обычно проверяли наиболее частые анеуплоидии.

Что такое NGS​

NGS это секвенирование нового поколения. Метод позволяет одновременно анализировать все хромосомы и получать более детальную картину генетического материала эмбриона.
NGS даёт возможность выявлять анеуплоидии по всему набору, сегментные изменения и признаки мозаицизма.


Главные различия​

• FISH проверяет ограниченное количество хромосом
• NGS анализирует весь хромосомный набор
• FISH менее чувствителен к мелким изменениям
• NGS выявляет сегментные перестройки
• NGS чаще обнаруживает мозаичные варианты


Почему FISH используют реже​

По мере развития технологий NGS стал более информативным и универсальным методом. Он позволяет получить более полный генетический профиль эмбриона. Поэтому большинство современных лабораторий перешли на NGS.

Есть ли у NGS ограничения​

• возможны технические артефакты
• сложность интерпретации мозаицизма
• результат зависит от качества биопсии

Важно помнить, что ни один метод не даёт абсолютной гарантии успешной беременности.


Когда стоит уточнить метод тестирования​

• если анализ делался несколько лет назад
• если результаты разных клиник отличаются
• если обсуждается перенос мозаичного эмбриона
• если у пары есть структурные перестройки хромосом


Что делать и чего не делать​


Что делать
• уточнить у клиники, какой метод используется
• попросить объяснить результат простыми словами
• при сложных случаях получить консультацию генетика

Чего не делать
• не сравнивать напрямую отчёты разных технологий
• не считать старый FISH равным современному NGS
• не делать выводы без пояснений врача


Пошаговый мини-план​


Шаг 1. Узнайте, какой метод использовался в вашем ПГТ.
Шаг 2. Уточните, какие хромосомы были проверены.
Шаг 3. Спросите о наличии сегментных изменений или мозаицизма.
Шаг 4. При необходимости получите второе мнение генетика.
Шаг 5. Совместно с врачом определите тактику переноса.


Мини-FAQ​

1) Что точнее FISH или NGS?
NGS считается более современным и информативным.

2) Может ли FISH пропустить анеуплоидию?
Если хромосома не входила в панель анализа, да.

3) Почему раньше делали FISH?
Это была доступная технология своего времени.

4) Нужно ли переделывать старое ПГТ?
Решение принимается индивидуально с врачом.

5) Влияет ли метод на шанс имплантации?
Метод влияет на точность отбора эмбрионов, но не исключает другие факторы.


Заключение​

FISH и NGS это этапы развития генетической диагностики в ЭКО. Сегодня чаще используется NGS из-за более широких возможностей анализа. Но интерпретация результатов всегда должна проводиться с учётом клинической картины и рекомендаций врача.

Если у вас есть отчёт ПГТ и вы не уверены, каким методом он выполнен, напишите в комментариях формулировку. Разберём спокойно и по шагам.

Редакция - EcoTopLab
 
Сверху