Генетическая совместимость пары обычно связана с исследованием носительства наследственных вариантов у двух партнёров. Значение имеет совпадение вариантов в одном и том же гене при заболеваниях с определённым типом наследования. Такое исследование отличается от оценки кариотипа и от генетического тестирования уже полученных эмбрионов.