Микрофлора влагалища включает различные группы микроорганизмов, соотношение которых может меняться в течение жизни и менструального цикла. В репродуктивном возрасте значительную роль обычно играют лактобациллы, участвующие в поддержании кислой среды. Изменения микробного состава могут сопровождать воспалительные и другие состояния интимной зоны.